バイオインフォマティクスの目次

informatics/informatics_meta/index_bioinformatics
2018/01/16 更新


Bioinformatics に関する目次です。Informatics の目次 から分離しました。


このページの内容

  1. 塩基配列の取り扱い
    • 基礎的な項目
    • Mac を使った配列解析
    • 分子系統樹

  2. 画像解析

その他の目次


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塩基配列の取り扱い

基礎的な項目

  1. 塩基配列解析に使われるファイルの特徴と扱い
  2. アラインメントの原理と主なプログラムの特徴
  3. BLAST
  4. ホモログ・オーソログ・パラログの定義

Mac を使った配列解析

インストール方法、ターミナル を使った解析など、実際的な項目をまとめてあります。

  1. Local BLAST
  2. CAP3 によるアセンブル

分子系統樹

  1. 分子系統樹の基礎
  2. 作り方: MEGA で最尤法
  3. 作り方: Linux 上の MEGA

画像解析

画像ファイルに関係する項目の目次です。Informatics の目次にある「基礎」と重複しているものもあります。

画像ファイルの基礎

  1. 画像ファイルの種類
  2. 画像の解像度とは
  3. 画像ファイルのプライバシー

各種ソフトの使い方

  1. XnView: 画像編集ソフト
  2. ImageJ を用いた色相 hue の解析

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