ファイル形式の一覧
UB3/informatics/informatics_meta/index_file_formats
このページの最終更新日: 2024/09/30
ファイル形式を拡張子のアルファベット順に一覧にして、簡単な説明と関連ページヘのリンクを加えました。拡張子だけでなく、不可視ファイルも含まれています。
以下のページとともに Informatics 関係の上位 (目次) ページの一つです。
A
.ab1
サンガーシークエンスの結果のファイル。
B
.bam
次世代シークエンス データの解析で出てくる。バイナリ形式。sam がテキスト形式のデータ。
C
.cnv
Canvas というグラフィックソフト (Illustrator のような) のファイル。オンラインで開く方法を探したが見つからない。無料で中身を見たいときは、30 日間使える試用版をダウンロードして pdf などに別名保存するのが良い。
.csv
コンマを区切り文字とした情報を格納した comma-separated values というテキストファイル。タブ、スペースを区切り文字とした tsv, ssv ファイルもある。
D
.db
拡張子 .db のファイルで一番よく見るのは
.docx
Microsoft Word のファイル。Word 2007 以降のバージョンの保存形式で、html に似たタグ形式のテキスト Open XML で構成されている。MS 製品が売れすぎて 無料のオフィス が多数生み出されるようになり、これに危機感を感じた Microsoft が、逆に自社製品をその形式に近づけたという面白い経緯があるらしい (1)。
.ds_store
Mac のシステムが各フォルダに作るファイル。ファイルやフォルダを開いたときの位置、大きさなどを記録している。消しても全く問題ない。
E
.eml
Microsoft が開発した Outlook および Outlook Express 向けのフォーマット。プレーンテキストで書かれているはずで、Mac Mail ほか様々なメールクライアントで開くことができる。
2019 年 3 月、ターミナルで中身を見ようと画策。文字コードが US-ASCII
.ens
論文編集用ソフト EndNote のスタイルが収められたファイル。
F
.fasta, .fastq
塩基配列に関係するファイル形式 を参照のこと。
.fmp12
Filemaker のファイル。
G
.gz
Mac, Linux などの gzip コマンドで圧縮されたファイル。tar で複数のファイルをアーカイブし、さらに圧縮すると拡張子は .tar.gz となる。NCBI から配布されているゲノム配列などのファイルは、tar.gz 形式であることが多い。
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H
.htaccess
ウェブページをリダイレクトするためにサーバーに置くファイル。301 リダイレクト を参照。ドットから始まる不可視ファイルである。
M
.m4a
動画ファイルの mp4 と同じ規格だが、画像データを含まず、音声のみを含んでいるファイル。mp3 と同様の機能を持ちながらファイルサイズを小さくできるので、mp3 の次世代形式とされている (2)。
.mkv
動画ファイルだが、iTunes でサポートされていない。Mac では Handbrake というフリーソフトで .mp4 に変換できる (参考: ブログ)。
.msg
Windows Outlook のフォーマット。Windows から Mac にメールを転送すると、.msg という拡張子の添付ファイルとして転送されてしまう場合があり、非常にうっとおしい。開くためにアプリを入れるのも躊躇されるので、ベストのオプションは Web ベースで中身が見られる Free Online .MSG and .EML Viewer だ。.msg ファイルをアップロードすることで、中身を見ることができる。情報が盗まれていないという保証はないので、重要じゃない .msg 限定か。
N
.nwk
Linux の MEGA で 分子系統樹 を作ったときに出力される tree のフォーマット。MEGA で開くことができるが、FigTree を使えばさらに色々なパターンで描画できる。Newick 形式という。
.nxs
Nexus 形式。.nwk 以外でよく使われる系統樹のフォーマット。
O
.ods
Libre Office など 無料のオフィスソフト の拡張子。エクセルに相当する表計算のファイル。
P
.psd
Adobe Photoshop のファイル。Photoshop を買わなくても、オンラインで無料で編集できるツールがけっこうある。Photopea がお気に入り。
S
.sra
NCBI データベースからダウンロードされる 次世代シークエンス のデータ形式。
.srt
動画ファイル mkv の字幕が、表示する時間とともに格納されている。
.svg
Scalable vector graphics の略で、2001 年ごろにできた 画像ファイル のフォーマット。jpg や png とは違いベクター形式である。最近、対応ブラウザが増えてきたためにウェブサイトでよく使われるようになってきた。
.swf
Flash 形式の動画フォーマット。Flash はインターネット動画の中心的なフォーマットだったが、脆弱性や高負荷などの問題から 2020 年末にサポートが中止される予定である。
T
.tar
tar 形式のアーカイブファイル。Mac や Linux では tar コマンドで展開できる。複数のファイルを一つにまとめているが、圧縮はしていない。tar でまとめたファイルをさらに gzip でコマンドで圧縮すると、拡張子は .tar.gz となる。NCBI から配布されているゲノム配列などのファイルは、tar.gz 形式であることが多い。
.ttc
Mac のフォントファイル。ダブルクリックすると Font Book が開き、新しいフォントをインストールできる。
.txt
テキストファイル という文字コードのに従う情報のみのファイル。詳細はリンク先を参照。
.tex
Latex のファイル。参考: Ubuntu への Latex 環境の導入。
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References
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