ファイル形式の一覧

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このページの最終更新日: 2023/02/14


ファイル形式を拡張子のアルファベット順に一覧にして、簡単な説明と関連ページヘのリンクを加えました。拡張子だけでなく、不可視ファイルも含まれています。

以下のページとともに Informatics 関係の上位 (目次) ページの一つです。

A

.ab1

サンガーシークエンスの結果のファイル。

B

.bam

次世代シークエンス データの解析で出てくる。バイナリ形式。sam がテキスト形式のデータ。

C

.cnv

Canvas というグラフィックソフト (Illustrator のような) のファイル。オンラインで開く方法を探したが見つからない。無料で中身を見たいときは、30 日間使える試用版をダウンロードして pdf などに別名保存するのが良い。

.csv

コンマを区切り文字とした情報を格納した comma-separated values というテキストファイル。タブ、スペースを区切り文字とした tsv, ssv ファイルもある。

D

.db

拡張子 .db のファイルで一番よく見るのは Thumbs.db というファイルだろう。これはWindows エクスプローラが勝手に作成する画像のキャッシュファイルである。これを作っておくと、次回からサムネイルを早く表示できるようになる。通常は隠しファイルになっているが、Mac だと見えてしまったりすることがある。削除しても全く問題ない。

.docx

Microsoft Word のファイル。Word 2007 以降のバージョンの保存形式で、html に似たタグ形式のテキスト Open XML で構成されている。MS 製品が売れすぎて 無料のオフィス が多数生み出されるようになり、これに危機感を感じた Microsoft が、逆に自社製品をその形式に近づけたという面白い経緯があるらしい (1)。

.ds_store

Mac のシステムが各フォルダに作るファイル。ファイルやフォルダを開いたときの位置、大きさなどを記録している。消しても全く問題ない。

E

.eml

Microsoft が開発した Outlook および Outlook Express 向けのフォーマット。プレーンテキストで書かれているはずで、Mac Mail ほか様々なメールクライアントで開くことができる。

2019 年 3 月、ターミナルで中身を見ようと画策。文字コードが US-ASCII

.ens

論文編集用ソフト EndNote のスタイルが収められたファイル。

F

.fasta, .fastq

塩基配列に関係するファイル形式 を参照のこと。

.fmp12

Filemaker のファイル。

G

.gz

Mac, Linux などの gzip コマンドで圧縮されたファイル。tar で複数のファイルをアーカイブし、さらに圧縮すると拡張子は .tar.gz となる。NCBI から配布されているゲノム配列などのファイルは、tar.gz 形式であることが多い。


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H

.htaccess

ウェブページをリダイレクトするためにサーバーに置くファイル。301 リダイレクト を参照。ドットから始まる不可視ファイルである。

M

.m4a

動画ファイルの mp4 と同じ規格だが、画像データを含まず、音声のみを含んでいるファイル。mp3 と同様の機能を持ちながらファイルサイズを小さくできるので、mp3 の次世代形式とされている (2)。

.mkv

動画ファイルだが、iTunes でサポートされていない。Mac では Handbrake というフリーソフトで .mp4 に変換できる (参考: ブログ)。

.msg

Windows Outlook のフォーマット。Windows から Mac にメールを転送すると、.msg という拡張子の添付ファイルとして転送されてしまう場合があり、非常にうっとおしい。開くためにアプリを入れるのも躊躇されるので、ベストのオプションは Web ベースで中身が見られる Free Online .MSG and .EML Viewer だ。.msg ファイルをアップロードすることで、中身を見ることができる。情報が盗まれていないという保証はないので、重要じゃない .msg 限定か。

N

.nwk

Linux の MEGA分子系統樹 を作ったときに出力される tree のフォーマット。MEGA で開くことができるが、FigTree を使えばさらに色々なパターンで描画できる。Newick 形式という。

.nxs

Nexus 形式。.nwk 以外でよく使われる系統樹のフォーマット。

O

.ods

Libre Office など 無料のオフィスソフト の拡張子。エクセルに相当する表計算のファイル。

P

.psd

Adobe Photoshop のファイル。Photoshop を買わなくても、オンラインで無料で編集できるツールがけっこうある。Photopea がお気に入り。

S

.sra

NCBI データベースからダウンロードされる 次世代シークエンス のデータ形式。

.srt

動画ファイル mkv の字幕が、表示する時間とともに格納されている。

.svg

Scalable vector graphics の略で、2001 年ごろにできた 画像ファイル のフォーマット。jpg や png とは違いベクター形式である。最近、対応ブラウザが増えてきたためにウェブサイトでよく使われるようになってきた。

.swf

Flash 形式の動画フォーマット。Flash はインターネット動画の中心的なフォーマットだったが、脆弱性や高負荷などの問題から 2020 年末にサポートが中止される予定である。

T

.tar

tar 形式のアーカイブファイル。Mac や Linux では tar コマンドで展開できる。複数のファイルを一つにまとめているが、圧縮はしていない。tar でまとめたファイルをさらに gzip でコマンドで圧縮すると、拡張子は .tar.gz となる。NCBI から配布されているゲノム配列などのファイルは、tar.gz 形式であることが多い。

.ttc

Mac のフォントファイル。ダブルクリックすると Font Book が開き、新しいフォントをインストールできる。

.txt

テキストファイル という文字コードのに従う情報のみのファイル。詳細はリンク先を参照。

.tex

Latex のファイル。参考: Ubuntu への Latex 環境の導入


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References

  1. docとdocxファイルの違いを教えてください。 Link: Last access 5/19/2017.
  2. M4P フォーマットとは何? Link: Last access 9/11/2017.

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